SNP檢測服務(FLu-Arms)

2020-12-12 10:24

SNP介紹及其應用

SNP(SingleNucleotidePolymorphisms)是指基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA序列多态性,在群體中的發生頻率不小于1%。包括單個堿基的轉換、颠換、插入和缺失等。SNP在動物基因組中分布廣泛,每一個核苷酸發生突變的概率大約爲10-9。由于選擇壓力,SNP在單個基因、整個基因組中以及種群間的分布是不均勻的。
SNP分析技術按其研究對象主要分爲兩大類,即:一是對未知SNP進行分析,即找尋未知的SNP或确定某一未知SNP與某遺傳病的關系。但這些方法隻能發現含有SNP的DNA鏈,不能确知突變的位置和堿基類别,要想做到這一點,必須對那些含有SNP的DNA鏈進行測序。二是對已知SNP進行分析,即對不同群體SNP遺傳多樣性檢測或在臨床上對已知緻病基因的遺傳病進行基因診斷。由于人類基因工程的帶動,許多物種都已開始了基因組的項目,并建立了大量數據庫,比較這些來自不同實驗室不同個體的序列,就可以檢測到SNP。

固德生物FLu-Arms技術優勢

針對已知 SNP 進行分析, FLu-Arms方法和KASP等競争性等位基因特異性PCR類似(Competitive Allele Specific PCR),對目标SNPs和InDels進行精準的雙等位基因分型。通過兩個位點特異探針以及2個熒光探針來檢則多個SNP位點,以及利用開發的全自動一體化DNA抽提、熒光定量PCR工作平台,快速檢測大量SNP位點,在醫學、農學檢測方面 FLu-Arms都有非常好的應用。

·         檢測成本低;不需要每個SNP位點都去合成特異的熒光引物,它基于自己獨特的ARM PCR原理,讓所有的位點檢測最終都使用通用熒光引物擴增,這大大降低了試劑成本。合成的探針可用于上千樣本的檢測。

·         檢測時間短;全自動的工作平台及超大通量,使得實驗最短的時間内完成檢測。

·         檢測通量高;自動一體化DNA抽提、熒光定量PCR工作平台,使得能夠批量操作96通道或384通道樣品,處理及加樣的一緻性較好,實現大量樣品及位點檢測。

·         結果準确分型:基于終端熒光讀取判斷,每孔采用雙色熒光檢測一個樣本的一個位點可能的兩種基因型,不同的SNP模闆對應不同的熒光産物。所以這項技術的準确度與金标準Taqman一緻。

·         一站式服務:從提供生物樣本開始,進行探針設計、DNA抽提、檢測到分析結果。提供省心省力的一站式服務。

SNP檢測流程

    引物設計與驗證--DNA提取--反應體系制備---PCR上機--熒光讀取和數據分析

   

FLu-Arms術介紹



完全标準化的PCR擴增程序


step 1

預變性

95

1 min

1 循環

step 2

降落PCR

95

5 s

9 循環

63.457

-0.8/循環

15 s

step 3

擴增

95

5 s

35 循環

57.5

15 s

step 4

讀闆

16

20 s read

2 循環



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